Rootkit-i – napadalec namesti rootkit na računalnik, da ga lahko izkorišča - kontrolira. Namestitev rootkita na računalnik lahko poteka na več načinov. Vsekakor pa so to najbolj zaskrbljujoči nezaželjeni programi, ki se skrivajo že novi strojni opremi (USB ključki, tiskalniki... Podatknjeni so lahko celo v računalniške miške.)